拉丁学名：Bacillus natto
形态特征：纳豆芽孢杆菌通常为（0.7-0.8)µm×(2.0-3.0)µm, 革兰、氏阳性。生长在葡萄糖琼脂的细胞原生质染色均匀。芽孢椭圆形或柱状，中生或偏中生，即使孢囊膨大，也不显著，有鞭毛，能运动。生长温度高位45-55℃，低为5-20℃。孢子耐热性强。
生态习性：纳豆芽孢杆菌是从纳豆制品中或从自然界的稻、谷上面分离得到。日本传统的做法是把煮熟的大豆趁热装在用稻草做成的器皿里，利用稻草上附着的纳豆菌自然发酵而做成的。用这种方法做成的纳豆中，除了纳豆菌以外，还含有其他杂菌，不仅卫生不过关，而且质量也不好。
孢子型纳豆菌是具有耐酸、耐热特性的有益菌,在胃酸下四小时活率为100,同时具有病原菌抑制能力,是各种益菌当中,对环境耐受力好可以直达小肠的菌种之一,口服后可改变人体肠道菌丛生态,帮消化道机能正常化,以使排便顺畅,维持体内生理环保。可以产酸，增强动物细胞免疫放应。并能生成多种蛋白 酶（特别是碱性蛋白 酶）、糖化酶、脂肪酶、淀粉 酶，降解植物性饲料种某些复杂的碳水化合物，从而提高饲料的转化率。
经济价值：利用纳豆菌可以制造纳豆。因纳豆菌是嗜氧菌,接触空气是很重要的。纳豆菌在通过吞噬大豆蛋白来繁殖的时候,产生出的无数酵素纳豆激酶和维生素K,具有的药效,可以治三高（高血糖，高血压，高血脂）和溶解血栓的作用，而且还能产生出氨基酸的美味。几十年来，随着纳豆的有益健康的功能不断被发现，纳豆在日本不断掀起”纳豆热潮"。
近年来，纳豆芽孢杆菌开始用于饲料添加中。
